Les gastro-entérites
Diarrhée de l’adulte
En pratique, on parle de diarrhée lorsqu’il y a plus de trois selles molles ou liquides par jour.
Une diarrhée est dite aiguë si elle évolue depuis moins de 2 semaines.
→ Dans ce cas-là, la cause est principalement infectieuse.
Quand faut-il faire un examen microbiologique des selles?
4 principales situations d’urgence
- Déshydratation ou sujet à risque de déshydratation (nourrisson, personne âgée ou polymédiquée)
- Risque de sepsis (immunodéprimé, neutropénique, personne âgée, drépanocytaire…)
- Syndrome occlusif
- Retour de pays d’endémie palustre (ajouter une recherche de paludisme)
Autres recommandations de prescription
- Diarrhée fébrile, hémorragique, syndrome cholériforme ou dysentérique
- Retour des tropiques
- Signes de gravité
- Toute diarrhée post traitement antibiotique ou en cours de traitement antibiotique
- Immunodépression
- Taxi-infection alimentaire collective (TIAC) selon contexte
- Diarrhée en collectivité (EHPAD)
Que faut-il prescrire?
Cela dépend du contexte clinique
Coproculture
- Campylobacter (bactérie la plus isolée en France)
- Salmonella
- Shigella
- Yersinia
Recherche de Clostridium difficile
Classiquement, il s’agit de la diarrhée en cours de traitement ou post traitement antibiotique. Il y a un fort sous diagnostic en France. De nouvelles tendances montrent la progression du nombre de cas communautaires et l’apparition de formes atypiques.
Recherche Bactérienne spécifique
- E coli Entéro Hémorragique (EHEC): on retrouve des cas sporadiques, mais parfois graves d’infection avec ce type de bactéries. Elles sont à l’origine du SHU chez l’enfant et plus rarement chez l’adulte (E coli 0157H7 et steaks hachés; en 2011, la présence de O104H4 dans des graines à germer fait 35 morts en Allemagne)
- E coli Entéro Toxinogène (ETEC): Bactérie de la « turista »
- Vibrio: Il faut distinguer le V. cholerae (choiera), épidémies présentes dans différents pays (à suivre selon l’actualité) des autres Vibrio parahaemolyticus (consommation de coquillages) y compris en France
Parasitologie des selles (à renouveler 3 fois sur 10 jours – à préciser sur l’ordonnance)
- Giardia intestinalis
- Cryptosporidie (sur demande spécifique)
Cas d’un retour de voyage: Amibes et autres parasites
Virologie des selles
- Rotavirus
- Adenovirus
- Norovirus (sur demande spécifique) : En 2018 il est l’un des principaux virus retrouvés en France. À l’origine d’épidémies en collectivité mais aussi de TIAC (fruits rouges congelés, coquillages)
- Sapovirus (sur demande spécifique)
- Astrovirus (sur demande spécifique)
Orientations diagnostiques devant une diarrhée du voyageur
Répartition des virus endémiques par tranche d’âge (%)
Grâce aux avancées de la biologie moléculaire : la plupart des virus endémiques peuvent être recherchés au laboratoire.
Comment traiter ?
- Le premier traitement est symptomatique avec la réhydratation, voire la mise en place d’un traitement anti sécrétoire.
- Un traitement antibiotique probabiliste peut-être prescrit dans les cas graves ou sur documentation microbiologique.
- Mise en place de mesures d’hygiènes.
À savoir
- La nomenclature précise que les recherches de Clostridium difficile, Escherichia coli entéro-pathogène, Vibrio, Cryptosporidies, norovirus et parasites ne peuvent être faites que sur demande explicite (préciser ces demandes sur votre ordonnances en fonction du contexte clinique).
- Préciser la recherche d’un germe particulier si besoin.
- Dans le cadre des TIAC prendre contact avec votre ARS.
Les renseignements à nous transmettre : Voyage, prise d’antibiotiques, TIAC, durée et intensité de la diarrhée, fièvre.
